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甘蓝型油菜作图群体亲本基因组及性状QTL密集区变异特点
Author: 程明星,童超波,程晓晖,刘越英,刘立江,柴国华,黄军艳*,刘胜毅.
Source: 中国油料作物学报
Issued Date: 2017-12
Volume: 39, Issue:4, Pages:427-436
DOI: DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2017.04.001
DOC Type: Article
Abstract: 为了解作图群体亲本间基因组和密集QTL区的遗传变异,促进QTL定位与克隆,本研究对一个甘蓝型油菜(Brassica napus)重组自交系(recombinant lnbred lines,RIL)群体双亲M083和888-5(二者株高、分枝数、开花时间、菌核病抗性等性状差异显著)的基因组进行深度测序和分析。研究结果表明:在M083和888-5中分别检测到SNP个数为1 941 397和2 046 009,In Del个数为410 961和428 572,结构变异个数为90 384和88 456,拷贝数变异个数为46 655和46 008。对包含开花时间、菌核病抗性、株高等多个性状主效QTL密集的A02染色体进行分析发现,在包括上述性状QTL密集的6.4~6.9Mb的0~8.5Mb基因组区间内,两品系SNPs和In Dels变异数量/密度总体呈相反的趋势;片段丢失也有热点区,888-5和M083均在两个共同区域高频发生,其中一个为QTL密集区;倒位在染色体上的分布虽然也是不均匀的,但两品种间发生区域不同,且与QTL无关。本文关于基因组变异(SNPs、In Dels、除倒位外的结构变异)热点区和QTL密集区重复的结论对性状控制位点精细定位、基因克隆及育种亲本选择有一定的指导意义
WOS Keyword Plus: 作图群体, QTL, 亲本, 油菜, 基因组变异特点,
Language: 中文
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Content Type: 期刊论文
URI: http://ir.qibebt.ac.cn/handle/337004/9834
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甘蓝型油菜作图群体亲本基因组及性状QTL密集区变异特点.pdf(2369KB)期刊论文作者接受稿开放获取View Download

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程明星,童超波,程晓晖,刘越英,刘立江,柴国华,黄军艳*,刘胜毅.. 甘蓝型油菜作图群体亲本基因组及性状QTL密集区变异特点[J]. 中国油料作物学报,2017,39(4):427-436.
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